Protein–RNA interactions for Protein: Q12028

APL4, AP-1 complex subunit gamma-1, yeastyeast

Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL4Q12028 snR77snR77 88 nt-0.93□□□□□ -2.56
APL4Q12028 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.94□□□□□ -2.56
APL4Q12028 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1□□□□□ -2.57
APL4Q12028 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.02□□□□□ -2.57
APL4Q12028 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.05□□□□□ -2.58
APL4Q12028 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.05□□□□□ -2.58
APL4Q12028 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.06□□□□□ -2.58
APL4Q12028 snR53snR53 91 nt-1.09□□□□□ -2.58
APL4Q12028 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.19□□□□□ -2.6
APL4Q12028 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.25□□□□□ -2.61
APL4Q12028 snR6snR6 112 nt-1.35□□□□□ -2.63
APL4Q12028 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.36□□□□□ -2.63
APL4Q12028 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.44□□□□□ -2.64
APL4Q12028 YOR309CYOR309C 381 nt-1.52□□□□□ -2.65
APL4Q12028 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.53□□□□□ -2.65
APL4Q12028 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.54□□□□□ -2.66
APL4Q12028 YNR077CYNR077C 255 nt-1.56□□□□□ -2.66
APL4Q12028 snR73snR73 106 nt-1.57□□□□□ -2.66
APL4Q12028 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.75□□□□□ -2.69
APL4Q12028 snR40snR40 97 nt-1.96□□□□□ -2.72
APL4Q12028 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.17□□□□□ -2.76
APL4Q12028 snR58snR58 96 nt-2.23□□□□□ -2.77
APL4Q12028 snR75snR75 89 nt-2.31□□□□□ -2.78
APL4Q12028 snR87snR87 109 nt-2.37□□□□□ -2.79
APL4Q12028 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.43□□□□□ -2.8
APL4Q12028 YDR543CYDR543C 300 nt-2.81□□□□□ -2.86
APL4Q12028 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.32□□□□□ -2.94
APL4Q12028 YJR162CYJR162C 351 nt-3.88□□□□□ -3.03
APL4Q12028 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.1□□□□□ -3.07
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