Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 snR53snR53 91 nt-0.61□□□□□ -2.51
YPQ1Q12010 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.62□□□□□ -2.51
YPQ1Q12010 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.64□□□□□ -2.51
YPQ1Q12010 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.65□□□□□ -2.51
YPQ1Q12010 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
YPQ1Q12010 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPQ1Q12010 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPQ1Q12010 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
YPQ1Q12010 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.78□□□□□ -2.53
YPQ1Q12010 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.78□□□□□ -2.53
YPQ1Q12010 snR6snR6 112 nt-0.85□□□□□ -2.55
YPQ1Q12010 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.9□□□□□ -2.55
YPQ1Q12010 YOR309CYOR309C 381 nt-0.99□□□□□ -2.57
YPQ1Q12010 snR73snR73 106 nt-1□□□□□ -2.57
YPQ1Q12010 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.05□□□□□ -2.58
YPQ1Q12010 YNR077CYNR077C 255 nt-1.07□□□□□ -2.58
YPQ1Q12010 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
YPQ1Q12010 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.08□□□□□ -2.58
YPQ1Q12010 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.1□□□□□ -2.59
YPQ1Q12010 snR40snR40 97 nt-1.24□□□□□ -2.61
YPQ1Q12010 snR75snR75 89 nt-1.44□□□□□ -2.64
YPQ1Q12010 snR58snR58 96 nt-1.54□□□□□ -2.66
YPQ1Q12010 snR87snR87 109 nt-1.57□□□□□ -2.66
YPQ1Q12010 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.64□□□□□ -2.67
YPQ1Q12010 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.74□□□□□ -2.69
YPQ1Q12010 YDR543CYDR543C 300 nt-2.46□□□□□ -2.8
YPQ1Q12010 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.79□□□□□ -2.86
YPQ1Q12010 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.83□□□□□ -2.86
YPQ1Q12010 YJR162CYJR162C 351 nt-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.9 ms