Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSME1Q06323 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSME1Q06323 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms