Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmn1r236Q05A06 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmn1r236Q05A06 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmn1r236Q05A06 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vmn1r236Q05A06 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r236Q05A06 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r236Q05A06 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vmn1r236Q05A06 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vmn1r236Q05A06 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vmn1r236Q05A06 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r236Q05A06 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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