Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AgrpP56473 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrpP56473 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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