Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab4aP56371 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab4aP56371 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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