Protein–RNA interactions for Protein: P53753

DSE4, Endo-1,3(4)-beta-glucanase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE4P53753 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.35□□□□□ -2.35
DSE4P53753 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.23□□□□□ -2.37
DSE4P53753 snR161snR161 161 nt0.12□□□□□ -2.39
DSE4P53753 YJL113WYJL113W 4647 nt0.01□□□□□ -2.41
DSE4P53753 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.03□□□□□ -2.41
DSE4P53753 snR6snR6 112 nt-0.05□□□□□ -2.42
DSE4P53753 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.15□□□□□ -2.43
DSE4P53753 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.23□□□□□ -2.45
DSE4P53753 snR73snR73 106 nt-0.25□□□□□ -2.45
DSE4P53753 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.35□□□□□ -2.47
DSE4P53753 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.37□□□□□ -2.47
DSE4P53753 URB1YKL014C 5295 nt-0.4□□□□□ -2.47
DSE4P53753 snR58snR58 96 nt-0.51□□□□□ -2.49
DSE4P53753 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.51□□□□□ -2.49
DSE4P53753 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.56□□□□□ -2.5
DSE4P53753 snR33snR33 183 nt-0.57□□□□□ -2.5
DSE4P53753 YOR309CYOR309C 381 nt-0.61□□□□□ -2.51
DSE4P53753 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE4P53753 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE4P53753 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
DSE4P53753 snR87snR87 109 nt-0.9□□□□□ -2.55
DSE4P53753 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.93□□□□□ -2.56
DSE4P53753 YNR077CYNR077C 255 nt-0.97□□□□□ -2.56
DSE4P53753 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.09□□□□□ -2.58
DSE4P53753 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.66□□□□□ -2.68
DSE4P53753 YDR543CYDR543C 300 nt-2.15□□□□□ -2.75
DSE4P53753 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.29□□□□□ -2.78
DSE4P53753 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.69□□□□□ -2.84
DSE4P53753 YJR162CYJR162C 351 nt-2.98□□□□□ -2.89
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.4 ms