Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Upp1P52624 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms