Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
CUE2P36075 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.19□□□□□ -2.38
CUE2P36075 snR161snR161 161 nt0.14□□□□□ -2.39
CUE2P36075 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.08□□□□□ -2.4
CUE2P36075 snR6snR6 112 nt0.07□□□□□ -2.4
CUE2P36075 YJL113WYJL113W 4647 nt-0□□□□□ -2.41
CUE2P36075 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.04□□□□□ -2.42
CUE2P36075 snR73snR73 106 nt-0.08□□□□□ -2.42
CUE2P36075 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.13□□□□□ -2.43
CUE2P36075 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.19□□□□□ -2.44
CUE2P36075 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.2□□□□□ -2.44
CUE2P36075 URB1YKL014C 5295 nt-0.26□□□□□ -2.45
CUE2P36075 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.27□□□□□ -2.45
CUE2P36075 snR58snR58 96 nt-0.31□□□□□ -2.46
CUE2P36075 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.35□□□□□ -2.47
CUE2P36075 YOR309CYOR309C 381 nt-0.37□□□□□ -2.47
CUE2P36075 snR33snR33 183 nt-0.41□□□□□ -2.48
CUE2P36075 snR87snR87 109 nt-0.55□□□□□ -2.5
CUE2P36075 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
CUE2P36075 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
CUE2P36075 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.63□□□□□ -2.51
CUE2P36075 YNR077CYNR077C 255 nt-0.7□□□□□ -2.52
CUE2P36075 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.78□□□□□ -2.53
CUE2P36075 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
CUE2P36075 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.48□□□□□ -2.65
CUE2P36075 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.86□□□□□ -2.71
CUE2P36075 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.07□□□□□ -2.74
CUE2P36075 YDR543CYDR543C 300 nt-2.11□□□□□ -2.75
CUE2P36075 YJR162CYJR162C 351 nt-3.02□□□□□ -2.89
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 6 ms