Protein–RNA interactions for Protein: P34219

TOD6, Transcriptional regulatory protein TOD6, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOD6P34219 YOL014WYOL014W 375 nt0.3□□□□□ -2.36
TOD6P34219 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.23□□□□□ -2.37
TOD6P34219 YJL113WYJL113W 4647 nt0.2□□□□□ -2.38
TOD6P34219 snR161snR161 161 nt0.15□□□□□ -2.39
TOD6P34219 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt0.01□□□□□ -2.41
TOD6P34219 snR6snR6 112 nt0□□□□□ -2.41
TOD6P34219 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.03□□□□□ -2.41
TOD6P34219 snR73snR73 106 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOD6P34219 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOD6P34219 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-0.2□□□□□ -2.44
TOD6P34219 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.28□□□□□ -2.45
TOD6P34219 URB1YKL014C 5295 nt-0.28□□□□□ -2.45
TOD6P34219 snR58snR58 96 nt-0.31□□□□□ -2.46
TOD6P34219 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.35□□□□□ -2.46
TOD6P34219 snR33snR33 183 nt-0.48□□□□□ -2.49
TOD6P34219 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
TOD6P34219 YOR309CYOR309C 381 nt-0.52□□□□□ -2.49
TOD6P34219 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
TOD6P34219 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
TOD6P34219 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.66□□□□□ -2.52
TOD6P34219 snR87snR87 109 nt-0.73□□□□□ -2.53
TOD6P34219 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.9□□□□□ -2.55
TOD6P34219 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.92□□□□□ -2.56
TOD6P34219 YNR077CYNR077C 255 nt-1.06□□□□□ -2.58
TOD6P34219 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.7□□□□□ -2.68
TOD6P34219 YDR543CYDR543C 300 nt-2.07□□□□□ -2.74
TOD6P34219 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-2.26□□□□□ -2.77
TOD6P34219 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.33□□□□□ -2.78
TOD6P34219 YJR162CYJR162C 351 nt-2.9□□□□□ -2.87
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms