Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd28P31041 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cd28P31041 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cd28P31041 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd28P31041 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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