Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpbP27790 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CenpbP27790 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms