Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NelfeP19426 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NelfeP19426 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NelfeP19426 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms