Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
OtcP11725 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtcP11725 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtcP11725 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtcP11725 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OtcP11725 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtcP11725 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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OtcP11725 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OtcP11725 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms