Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem254bP0DN90 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem254bP0DN90 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms