Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tlx3O55144 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx3O55144 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms