Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppfibp2O35711 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppfibp2O35711 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms