Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn4O35054 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn4O35054 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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