Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps1O08983 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps1O08983 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms