Protein–RNA interactions for Protein: L7N271

Gm7970, Predicted gene 7970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7970L7N271 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm7970L7N271 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm7970L7N271 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm7970L7N271 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm7970L7N271 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm7970L7N271 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm7970L7N271 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm7970L7N271 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm7970L7N271 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm7970L7N271 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm7970L7N271 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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