Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm379J3QQ19 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm379J3QQ19 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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