Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msl3l2G3X992 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms