Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim15G3UY57 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms