Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rdh16f1E9Q9P8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rdh16f1E9Q9P8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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