Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd1D3YXK1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms