Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrc5C3VPR6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc5C3VPR6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms