Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms