Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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