Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP003174.3-201ENST00000537926 516 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC093821.1-201ENST00000503950 539 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TMEM106C-219ENST00000552546 742 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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