Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RNF7Q9UBF6 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RNF7Q9UBF6 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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