Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
IFFO1Q0D2I5 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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