Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
COL4A6Q14031 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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COL4A6Q14031 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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COL4A6Q14031 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 AC133965.1-201ENST00000452984 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
COL4A6Q14031 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
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