Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL520P-201ENST00000474110 286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SPINT1-AS1-204ENST00000568419 629 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL021154.1-201ENST00000451217 456 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CRYAB-215ENST00000533971 981 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC02178-201ENST00000566876 425 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms