Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snx1Q9WV80 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms