Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Tmod4Q9JLH8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Tmod4Q9JLH8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Tmod4Q9JLH8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tmod4Q9JLH8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmod4Q9JLH8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Tmod4Q9JLH8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmod4Q9JLH8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms