Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx5Q9D8U8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx5Q9D8U8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms