Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933402D24RikQ9D4D3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms