Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shisa9Q9CZN4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms