Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms