Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms