Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sntg1Q925E1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms