Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg13Q91YI1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg13Q91YI1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms