Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx15Q91WE1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx15Q91WE1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms