Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q91WD4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q91WD4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q91WD4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms