Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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H2afjQ8R1M2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2afjQ8R1M2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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