Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RorbQ8R1B8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms