Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ssh3Q8K330 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssh3Q8K330 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms