Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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