Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc50Q810U5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms