Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdc42bpbQ7TT50 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdc42bpbQ7TT50 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms